区别是石钟乳是自上而下的生长,石笋是自下而上的生长,石钟乳生长在洞顶,而石笋生长在洞底。石笋可以有不同的形状,水滴的流量、滴水的高度以及地面的状况均会影响石笋的形状。钟乳石的形成往往需要上万年或几十万年时间。由于形成时间漫长,钟乳石对远古地质考察有着重要的研究价值。
二者的形成是碳酸钙遇到溶有二氧化碳的水时,会反应生成溶解性较大的碳酸氢钙,溶有碳酸氢钙的水遇热或当压强突然变小时,溶解在水里的碳酸氢钙就会分解,重新生成碳酸钙沉积下来,同时放出二氧化碳。洞顶的水在慢慢向下渗漏时,水中的碳酸氢钙发生上述反应,有的沉积在洞顶,有的沉积在洞底,日久天长洞顶的形成石钟乳,洞底的形成石笋。或是另一种可能,石峰底座,由于地史时期地下水的长期溶蚀,河水的长期冲击,渐渐地形成了溶洞。溶洞继续被溶蚀扩大,而溶于水中的石灰岩溶液,从洞顶往下滴,甚至往下流,促进二氧化碳进一步扩散,同时溶液受蒸发作用,形成饱和,剩余的碳酸氢钙沉淀,就形成了石笋,石钟乳。
石笋是由于含碳酸的水不断点滴到一处,碳酸钙沉淀而形成的。可以有不同的形状,水滴的流量、滴水的高度以及地面的状况均会影响石笋的形状。除了特别干旱的年份,洞顶不再往下滴水外,石笋一般每年都会生长。随着季节的变化,洞顶滴下的水里面含的物质成分不同,这样一来,与树木形成的树轮一样,石笋也会形成自己的年轮,通过年轮还可以数出石笋的年龄。