Simone
首先，你要把这个基因的起始位点标出来，就给这么点序列，不好给你分析。上面的DNA序列也不像从头开始的啊。下面的RNA序列也不知道是从什么地方开始的。这段基因到底是在基因的什么位置搏者者？设计realtimePCR引物，一般选择mRNA的前边部分，另外，你这段序列的长度也不够，一共才119bp，扩增出来也不好区分，建议设计长度在150bp左右或者到200bp左右。可以明显降低实验的难度。引物二聚体的大学基本都差不多100bp大小了。为了实验方便，可以重新设计一下。至于你对比的序列，有一个缺失或者是多出来一个，都是有可能的，建议你从新做一些反转录，看看再扩增出来测序结果怎么样。基薯并且有这么一个缺少或者嫌咐插入，只要不是引物中间的，对引物的敏感性就没有明显影响。不影响realtimePCR试验的结果。
